分公司变更登记必须按照规定的流程依次向行政主管部门申请审批。无论是独立核算非公司还是非独立核算分公司，分公司的变更流程都是一样的。
1、前置审批项目变更
分公司经营范围中有前置审批项目的，必须先办理行业许可证的变更手续。但是，如果是办理分公司名称变更，则需最先到工商局办理《企业名称预先核准通知书》。
2、办理营业执照变更
必须先办理营业执照才能之后的组织机构代码证和税务登记证的变更。
3、刻章
公司名称、分公司负责人等变更时，在办理分公司营业执照变更手续后，需办理印章变更手续。
4、组织机构代码证及ic卡变更
5、税务登记证变更
此外，分公司变更程序中需注意的是：
1、分公司有进出口业务的，在办理分公司变更手续后，还需办理进出口备案登记变更。
2、办理分公司名称、负责人等变更时，还需办理分公司基本帐户的变更。
工商等行政部门的审批流程为：审查材料(材料不准确会被退回)，正式受理，变更登记并收取相关费用。
上述为内资分公司的变更流程，外资分公司变更要复杂些。
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